UCL小组利用超级计算机全球努力击败COVID-19

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jongho胫/ casarsaguru /盖蒂图片社

一组研究人员在英国伦敦大学学院的攻在美国和欧洲的超级计算机在努力想办法争取COVID-19,寻找疫苗和抗病毒的药物,等等。

该小组在伦敦大学学院是堪称联盟冠状病毒国际集团的一部分,是由世界各地的100名多名研究人员最多,包括那些在伦敦大学学院等八所大学,美国五个国家实验室,私人研究中心和公共学院。

除了疫苗和抗病毒的药物,他们正在研究社区内的病毒,如何与人体细胞相互作用的病毒创造更多病毒的传播和分析病毒基因组的结构,根据来自UCL释放。

该联盟是使用超级计算机对于它们最适合于诸如药物筛选化合物文库为可结合尖峰新型冠状病毒的表面上,并防止它侵入人体细胞的那些计算密集型任务。该库包括药物,化合物和可以快速地制造和它们是否适合对抗病毒的传播测试分子,UCL说。

“我们能够扫描现有的药物库,”伦敦大学学院教授化学彼得·科夫尼,谁领导卓越欧盟H2020计算生物医学中心说,“所以许多化合物我们正在寻找已经批准用于人类,因为它们是用于治疗存在的疾病,从而可以被重新定位到目标COVID-19。我们也能计算机生成应该很好地结合到病毒,这让我们在发现潜在新药一个梦幻般的开端新的化合物。”

该联盟正在利用所谓的斯科费尔峰在哈特里中心在柴郡,科学与技术设施委员会在达斯伯里实验室的一部分的超级计算机,一直致力于从超级计算机提供资源六个月的初期,根据UCL。

参与该项目的其他超级计算机是在阿贡国家实验室领导计算设施,布鲁克海文国家实验室,德克萨斯高级计算中心和圣地亚哥超级计算机中心,所有的美国二世界上最强大的超级计算机- 峰会在莱布尼茨Rechenzentrum高斯超级计算中心(GCS)(LRZ)(排名第一)在橡树岭国家实验室在美国和SuperMUC-NG(第九号)- 还可以是正在使用的联合体中。

该超级计算机采用机器学习,人工智能等方法来衡量效益,个别化合物可能有破坏COVID-19。“我们不仅需要找到如何这些绑定,当我们知道尖峰走动分子结合于冠状病毒的尖刺,但我们还需要的模式,”他说。

一旦超级计算机预测如何化合物可能阻止病毒蛋白质,例如,在钻石光源在英国和先进光子源在美国加速器,以确认使用的高强度X射线的那些预测。

“这是不是典型的药物开发过程中寻找合适的治疗方法的一个更快的方式,”Coveney说。“它通常需要医药公司12年和$ 2十亿采取一种药物从发现到市场,但我们通过强大的计算机来找到在那时间和成本的一小部分大海捞针重写规则”

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